Op de site van een Apple-liefhebber is een korte uitleg verschenen over het overklokken van de Mac mini. Deze nieuwe Mac is net als de meeste recente Apple-computers uitgevoerd met een processor van IBM uit de 744x-serie. Deze processor in combinatie met het gebruikte moederbord maken het mogelijk om de snelheid in te stellen door middel van jumpers. Door de jumpers R362, R358, R355 en R351 in te stellen op de gewenste waardes is het mogelijk om de processor te overklokken tot een maximale waarde van 1,58GHz. De auteur heeft zijn 1,25GHz-processor overgeklokt tot een snelheid van 1,42GHz, want bij een hogere processorsnelheid begon het benchmarkprogramma XBench rare waardes terug te geven, en met de snelheid van 1,58GHz zag de Mac mini de processor nog slechts als een 750MHz-exemplaar. Op ons eigen forum zijn al verschillende mensen te vinden die hun Mac mini open hebben gemaakt om geheugen bij te plaatsen en dit zonder de kast te beschadigen. Door het niet beschadigen van de kast blijft de garantie van Apple gehandhaafd, of dit ook het geval is bij het overklokken van de processor valt te bezien.

Naast het feit dat de Mac mini over te klokken is, komen er ook mensen op het idee om de inhoud van de Mac mini te vervangen door standaard pc-onderdelen. Kevin Rose heeft een poging gedaan om een vergelijking te maken tussen de Mac mini en een pc, maar dan wel per gebruikte kubieke centimeter. De Mac mini blijkt duidelijk een stuk snellere hardware te hebben als men kijkt naar wat Rose aan pc-onderdelen heeft weten in te passen: een VIA Nano ITX-moederbord met geïntegreerde 1GHz-processor is niet te vergelijken met de 1,2GHz-CPU van de Mac mini. Verder moet deze 'Mac mini-pc' het doen zonder cd-romspeler. Om het koelelement te laten passen in de kast van de mini moet er ook nog eens gezaagd worden. Al met al is de Mac mini een computer die wel heel veel waarde per kubieke centimeter geeft, besluit Rose.
