Op Slashdot is een bericht verschenen over een slechte ontwikkeling voor het XFree86-project. Dankzij een recente verandering in de licentie van het project, heeft een groot aantal distributeurs besloten om de nieuwste, nog te verschijnen, versie van XFree86 niet in hun distributies op te nemen. XFree86 is tot nu toe het meest gebruikte X11-systeem onder Linux.
De distributeurs die te kennen hebben gegeven in iedergeval geen XFree86 4.4.0 mee te leveren zijn Red Hat, Debian, Gentoo en Mandrake. Fedora, de gratis community variant van Red Hat, is bezig om de distributie geschikt te maken voor ondersteuning van andere X11-implementaties en zal dus mogelijk ook af zien van levering van XFree86. OpenBSD, een alternatief besturingssysteem wat niet is gebaseerd op Linux, heeft eveneens aangekondigd om de nieuwste XFree86 niet mee te leveren onder de huidige licentie.
Het probleem van de nieuwe licentie is dat men niet meer vrij is in het aanpassen en distribueren van de code zonder expliciet te vermelden dat de copyright van de code bij het XFree86-project ligt. Dit gaat in tegen de standaarden voor 'Free Software', zoals vastgelegd door de Free Software Foundation. Wat de distributies die de nog te verschijnen 4.4.0 versie niet mee gaan leveren nu gaan leveren is nog niet helemaal duidelijk. Waarschijnlijk zullen de meeste de huidige 4.3.0 versie blijven meeleveren om mogelijk in de toekomst over te stappen op een alternatieve X11-implementatie.
Naast XFree86 is ook Apache in opspraak geraakt vanwege licentieveranderingen. Dit laatste project is door de FSF eveneens aangemerkt als incompatible met GPL. Echter is dit probleem minder ernstig, aangezien Apache alleen enkele claims met betrekking tot patenten heeft opgenomen in haar licentie, iets wat mogelijk in de volgende versie van GPL ook zal zitten.